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Origin Pro如何快速绘制火山图教程

时间:2022-03-08 16:42作者:admin来源:未知人气:423我要评论(0)

火山图一般出现在生信或者组学的文章中,用来展示显著差异表达的基因。显著就是p值小于0.05,差异表达就是说两个基因表达的差异,一般按照Fold Change(倍数变化)≥2作为标准。 

volcano_plot App

链接:https://pan.baidu.com/s/1bR3NZl7AOuqJLvnffetqCw

提取码:gszw

数据准备这里我给大家准备了一个练习用的数据,大家可以下载下来进行练习。
链接:https://pan.baidu.com/s/1VCM8R5FMLaR1t6KxsDwgUw提取码:uh78640.jpeg
数据介绍这里我列了一个表格,也就是数据的表头,以此来介绍数据,方便大家理解。
640 (1).jpeg

教程1. 我们打开Origin软件,输入数据。这里我们只需要输入log2Fold Change值,以及p-adj值。(也有很多人直接使用P值直接作图,这种未校正出来的在作图之后,上调下调基因会很多,p值调节之后,基因数目会减少)
640.png2. 将log2Fold Change值设置为X轴640 (1).png3. 选中数据,点击火山图App640 (2).jpeg4. 设置对应的参数,即p值为0.05,Fold Change为2640 (2).png5. 成图,那么这就是一个最原始的图谱了640 (4).png6. 我们对各个标签进行调整,右击,删除其他的标签,只剩上调下调标签。640 (6).png640 (3).png7. 将坐标轴也进行调整,字体统一改成Time New Rowan 字体,22号,加粗。来看一下效果。640.png8. 双击图中的点,将没有显著性差异表达的设置成灰色就可以了,或者你可以设置成自己喜欢的颜色。640 (1).png9. 我们打开火山图自动生成的表格,来看一下上调基因和下调基因分别是多少,对应的行号就是上调下调的数目了。640 (8).png10. 双击图中的标签,最后标注相关信息640 (9).png11. 最终效果图640 (10).png

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