时间：2022-03-08 16:42作者：admin来源：未知人气：1593我要评论(0)
火山图一般出现在生信或者组学的文章中，用来展示显著差异表达的基因。显著就是p值小于0.05，差异表达就是说两个基因表达的差异，一般按照Fold Change(倍数变化)≥2作为标准。
volcano_plot App
链接：https://pan.baidu.com/s/1bR3NZl7AOuqJLvnffetqCw
提取码：gszw
数据准备这里我给大家准备了一个练习用的数据，大家可以下载下来进行练习。
链接：https://pan.baidu.com/s/1VCM8R5FMLaR1t6KxsDwgUw提取码：uh78
数据介绍这里我列了一个表格，也就是数据的表头，以此来介绍数据，方便大家理解。
教程1. 我们打开Origin软件，输入数据。这里我们只需要输入log2Fold Change值，以及p-adj值。（也有很多人直接使用P值直接作图，这种未校正出来的在作图之后，上调下调基因会很多，p值调节之后，基因数目会减少）
2. 将log2Fold Change值设置为X轴
3. 选中数据，点击火山图App
4. 设置对应的参数，即p值为0.05，Fold Change为2
5. 成图，那么这就是一个最原始的图谱了
6. 我们对各个标签进行调整，右击，删除其他的标签，只剩上调下调标签。
7. 将坐标轴也进行调整，字体统一改成Time New Rowan 字体，22号，加粗。来看一下效果。
8. 双击图中的点，将没有显著性差异表达的设置成灰色就可以了，或者你可以设置成自己喜欢的颜色。
9. 我们打开火山图自动生成的表格，来看一下上调基因和下调基因分别是多少，对应的行号就是上调下调的数目了。
10. 双击图中的标签，最后标注相关信息
11. 最终效果图
相关阅读 如何使用Origin Pro利用公式直接绘图并提取曲线数据如何利用Origin Pro进行体外释药规律的拟合SPSS实现经典统计学分析与偏度、峰度等常用统计学指标的计算EndNote英文论文的国内作者姓名显示名的第二个字首写字母的方法EndNote论文参考文献中文文章与英文文章先后排列顺序的修改EndNote论文参考文献的输出引用格式自定义修改与编辑界面详解如何使用Endnote在论文中插入图片Origin Pro如何快速绘制火山图教程Origin Pro中必须知道的快捷键Origin高效绘图技能，OLE功能详解，让你效率直接翻倍
热门文章
如何解决EndNotes在word不显示的问题
EndNote如何在WPS中使用，EndNote如何在WPS中插入和删除文献
如何用GraphPad Prism 进行显著性分析
Origin 如何在曲线图上添加各种标注的方法
最新文章
如何使用Origin Pro利用公式直接绘图并提取曲线数据
如何利用Origin Pro进行体外释药规律的拟合
SPSS实现经典统计学分析与偏度、峰度等常用统计学指标的计算EndNote英文论文的国内作者姓名显示名的第二个字首写字母的方法EndNote论文参考文献中文文章与英文文章先后排列顺序的修改EndNote论文参考文献的输出引用格式自定义修改与编辑界面详解
人气排行 如何解决EndNotes在word不显示的问题EndNote如何在WPS中使用，EndNote如何在WPS中插入和删除文献如何用GraphPad Prism 进行显著性分析Origin 如何在曲线图上添加各种标注的方法如何利用Origin进行多元线性回归、指数拟合和非线性曲面拟合？Endnote 如何导出GB/T 7714-2015 格式参考文献如何去掉EndNote插入Word的参考文献的超链接EndNote的同步功能Sync使用详解教程
盖楼回复X
(您的评论需要经过审核才能显示)
查看所有0条评论>>